Terza frazione dal profilo altimetrico movimentato con due salite, di cui l'ultima a circa 40 Km dall'arrivo, che possono favorire tentativi da lontano. La corsa si anima fin dal sedicesimo chilometro con un tentativo di due uomini il tedesco Christian Leben (Team Wiesenhof - Felt) e l'olandese Niki Terpstra (Team Milram) che guadagnano ben presto qualche minuto. Lungo la salita verso il GPM di Allerheiligen, a circa 70 Km dal traguardo, Terpstra si libera di Leben. A 54 Km dal termine Matthias Russ (Gerolsteiner) e Jon Bru Pascal (Euskaltel - Euskadi) si portano all’inseguimento di Terpstra che viene raggiunto a poco più di 45 Km dal traguardo dai due contrattaccanti e da Amael Moinard (Cofidis) che nel frattempo si era riportato su di loro.
Ai meno 8 Km rimangono al comando Russ e Moinard mentre da dietro si forma un gruppetto di una dozzina di contrattaccanti che comprende anche Matteo Carrara (Unibet.com), Damiano Cunego (Lampre – Fondital), Davide Rebellin (Gerolsteiner), il leader Jens Voigt (Team CSC), Levy Leipheimer (Discovery Channel), Franco Pellizotti (Liquigas).
Ma in prossimità dell'ultimo chilometro, il gruppo ridotto ad una cinquantina di unità torna compatto. Fasi concitate e volata finale. Parte lungo Gerard Ciolek (T-Mobile Team), ma si pianta a 100 metri dal termine e rischia di cadere. Arriva quindi Erik Zabel che prende la testa della corsa e non la molla fino al traguardo. Il tedesco del Team Milram (al suo tredicesimo successo al Giro di Germania), precede José Joaquin Rojas (Caisse d’Epargne), Bradley McGee (Française des Jeux) e Manuele Mori (Saunier Duval – Prodir).